ぽぽたんさん、はじめまして。
お子さん達ということはご兄弟で受けられて、同じような症状なのでしょうか?
ちょっとどのような状況か詳しくわからないのと、
不安なようであれば、明日に問い合わせするなどして今日は見合わせてもよいのではないでしょうか?

予防接種の接種医と診察された医師は同じかたなのでしょうか?

子供の咳って夜になるとひどくなるので不安ですよね。
加湿器置く、堅くしぼったタオルを干す、などして部屋の加湿をする。ちびちび水分補給。
タオルなどで上体を高くするなどしてみてはいかがですか?

お母さんの不安って伝染することもあるから、
「大丈夫だよ」っていって背中をさすってあげるだけでも楽になると思いますよ。うちの子、意識しているかわからないけどコクンって首ふってましたよ。