複雑に考えることはないでしょう。
智恵熱で良いと思います。
どうしてそうなるのか、詳しいメカニズムは説明できませんが、
ほとんどは、心配するようなものではないと思います。
心配する必要がないものを昔は智恵熱といったのでしょうから、それをわざわざ掘り起こして心配することなどないでしょう。

発熱時に手足がピクッとなるのは不思議ではありません。
発熱の体温はどこで生産されるのか。
発熱するには、骨格筋(体を動かす筋肉)を不随意に細かく動かすことであったりまします。当たり前の現象です。

文面から察する限り、私の印象では、異常なことはないと思います。