うまれて間もない赤ちゃんに、難しい病名が告げられたり、入院されたり、大変でしたね。文面からたいせいママさんご自身がかなり参ってしまっている様子が伺えます、大丈夫ですか?
ママの今の切羽詰った感が、赤ちゃんに伝わって、赤ちゃんも「なんだか不安」になって、泣き止まないということもあるようです。

赤ちゃんが泣き止まないのは、親としてほんとにつらいですが、泣くことは、赤ちゃんにとって必要な運動でもあるわけですから、絶対泣き止ませなくちゃ!とあまり力みすぎると逆効果になるかも。
赤ちゃんの世話はママだけの仕事ではないですし、誰か頼れる人がお近くにいらしたら、助けを借りて、泣く赤ちゃんをゆったり見ててあげてくださいね。

赤ちゃんにも泣きたい時、泣きたい時期と言うのもあるようです。
泣き方が病的でないなら、まずはママさんが少し休息を取って、この時期を何とかやり過ごしてくださいね。
病気の方も、このまま良くなりますように。