はまさん、かさねがさね詳しい情報をありがとうございます。
かかりつけの先生にお願いしてみます。

薬の使用によって、常在菌への抵抗力が落ちるというのは、とてもわかりますし、今回の息子の様子がそんな感じだったように思います。
副作用かどうかの医学的科学的な判断は難しいと思いますが、親としての判断は、今回は副作用であったと解釈して、今後服用は回避していこうと思います。
ことタミフルに関しては、息子にとっては絶対に必要というお薬ではないと思いますし・・・。
インフルエンザに負けない強い体を作っていけるよう親として頑張っていこうと思います。