心配ですね。
　インフルエンザの合併症ではないでしょうか。
　咽頭に感染し、所謂扁桃腺炎を起こしたとも考えられます。
　入院されているとのことですので、心配はないでしょうが、判らないことを不安に思っているより、医師や看護師に疑問をぶつけてみてはいかがですか?
　いずれにしても、早く回復されることをお祈りしています。