予防接種を受けない理由を説明しなさいと学校側から言われたら
それは行政指導にあたります。
「説明しなければならない理由」を説明してほしいと保健所長や区市町村長に請求することができます。
予防接種法の改正趣旨に乗っ取った説明をしてください。と

mixiの「予防接種は受けません」というコミュニティーから、請求書類をプリントアウトできます。
まず、そこまですることはないと思いますが、お守りに持っていると心強いです。

お子さんはアトピーとのことですので、アトピーなので・・・とやんわり逃げてはいかがでしょうか?

（　 携帯からの投稿です　）